O método usado para amostrar a enxurrada coletada em parcelas de erosão é importante fonte de erro. Realizamos um experimento para avaliar a eficiência do método de amostragem manual de enxurrada usado no Brasil. Observamos uma subestimação de 30% ou mais da concentração de sólidos totais. Como solução, desenvolvemos um fracionador de amostras para substituir o método de amostragem manual. Ele produziu amostras representativas sem alterar a distribuição de tamanho de partícula dos sólidos totais. Se os problemas com o método manual forem encontrados em outras áreas, o equipamento que desenvolvemos é uma alternativa razoável.
O MDS usa modelos estatísticos para quantificar a correlação entre propriedades do solo e condições ambientais para fazer predições em locais não amostrados. Seu sucesso depende, em grande medida, dos dados de amostragem do solo. É provável que uma estratégia amostral pobre ofereça um modelo pobre e grandes erros de predição, resultando em desperdício de recursos. Uma solução computacional é a otimização da configuração amostral usando a técnica do recozimento simulado.